太阳黑子和耀斑都是太阳大气上的活动现象。

太阳大气从内到外分别是光球层、色球层和日冕层。其中，光球层是我们凭肉眼和普通望远镜（通过合格的减光装置）看到的太阳圆面，太阳发出的可见光绝大部分来自光球。色球层包裹着光球层，比光球层厚，外边缘参差不齐，物质稀疏而透明，平时看不见，只有在日全食时才能直接观察到，看上去发出比较暗的玫瑰红色的辉光。不过，通过特殊的色球望远镜（也叫日珥镜），我们平时也可以观测太阳的色球层。

太阳黑子出现在光球层上，是光球表面温度相对较低的局部区域。实际上黑子的温度并不低，大约为4200℃，但太阳光球的平均温度约为5500℃，对比之下它就显得“黑”了。黑子经常成群出现，大小差别很大，大的黑子可以比地球还大许多。黑子最黑的中心部分称为本影，温度最低；外围不太黑的称为半影，温度要高不少。黑子是变化的，有时出现，有时消失，平均寿命约数月。黑子多的时候是太阳活动激烈的时候。

太阳耀斑则发生在色球层，是色球层突然出现的剧烈爆发现象，在短时间内释放大量能量，引起局部区域瞬时加热，向外发射各种电磁辐射，并伴随粒子辐射突然增强。一个中等大小的耀斑能量相当于1亿颗氢弹爆炸的能量！比较强烈的耀斑爆发，甚至可能会影响地球附近的近地空间。

太阳上的一群大黑子，能清晰地看到本影和半影。最大的比地球还大。  

（本回答主要参考了苏宜老师编著的《天文学新概论（第五版）》）